暗闇に現れる異形の存在「嚼塊異明神」は、人間の魂を喰らい、自らの体に吸収する忌まわしき存在。ある日、その異明神が道端の地蔵を破壊したことで、神と仏の魂が激突し、壮絶な衝突を起こす。その結果、神の魂は烏山家に、仏の魂は金城家に宿ることになる。

物語は、烏山という神社の神主が、自らの身体にもう一本の腕を持つ異形の存在であることから始まる。彼の三本目の腕は、死んだ双子の兄の名残であり、意志を持って動くこともある。ある日、黒いコートをまとった金城佐夫津という男が現れ、「家に祀っている“腕”を見せたい」と申し出る。彼が持ってきた紙の神殿と古書『烏山金城年代記』を使い、二人は異空間へと入っていく。

その異空間で明かされたのは、嚼塊異明神に纏わる呪いと、それぞれの家に落ちた“神と仏の魂”の真実。異明神が撒き散らした祟りは、両家の運命を歪ませており、黒く焦げた“腕”はその証であった。金城と烏山、互いの血に刻まれた因縁が今、再び交わろうとしている──。