2025年、翔太（12歳）のもとに、100年後の未来からひ孫のセリーヌ（14歳）が現れる。

このひ孫はとんでもないブットビおてんば娘。父親所有のタイムマシンを盗んで原始時代に遊びに行き、その帰りがけにふらりと立ち寄ったのだった。しかも、彼女は江戸時代に不時着して歴史を変えてしまっていた。

未来に戻ったセリーヌを待っていたのは、日本が滅び、無人と化した衝撃の世界だった。

彼女は涙ながらに翔太のもとへと舞い戻ってくる。衝撃的な未来を知った翔太と叔父の中年エスパー唯野一郎は、歴史をもとに戻すべくセリーヌとともに幕末に行くが、危機が次々に襲って来る。果たして彼らは歴史を元に戻し日本の未来を救うことができるのか。