地方都市・川北で続発する不可解事件を追う刑事・大山は、麻薬と宗教、暴力が絡む謎の集団「プラーナ・ペイチャック」と、その日本側の影「行真会」に行き詰まる。考古学者・山高や白水かおるらの調査から、行真の名が後白河法皇に通じ、東南アジアの麻薬組織、歴史上の怨念、宗教的因果が複雑に結びついていることが判明する。一方、刑事・羽間は、行真会の中枢に初恋の女性・小宮山祥子（胡蝶蘭マキ）と腹違いの血縁関係がある事実を知り、事件は個人的悲劇へと深化する。やがて大山は源頼朝の魂と覚醒的に融合し、不動明王として阿修羅化を阻止すべく、後白河院の怨念と対峙する運命に導かれていく。