裏社会で忍者が権力を握る世界、日本を一人『ニンジャマスター』と四大派閥の百地、服部、藤林、甲賀衆が治める中で突如『ニンジャマスター』が消息を絶ち、日本は四大派閥が治める事となった、しかし各派閥は静観を保ちつつも常に次の『ニンジャマスター』を狙いそれぞれが暗躍する。

そんな中ある事件が起こる、風魔党の頭領、風魔　虎太郎の娘で風間　狂子が謎の般若の仮面を被った男に襲撃を受け、それに助けに入ったのが謎の忍者、カゲロウであった。

忍者カゲロウを中心に暗躍する派閥争い、『ニンジャマスター』の座は誰が勝ち取り、消息した『ニンジャマスター』とは誰なのか。

忍者カゲロウの戦いと成長、そして恋愛を描いた忍者活劇。