3XXX年。
人々が心の安定をAIとネットワークに依存し、感情の波が管理され始めた近未来の日本。
匿名ボイスチャットツール「Code Void」に集うのは、それぞれ深い孤独と「後悔」を抱えた未成年のクリエイターたちだ。
チーム名は「零からのコード・ボイド」略してゼロイド。
ゼロイドリーダーのY（飽喰結那）は、かつて家族の心を救えなかった重いトラウマを抱え、その贖罪として、他者の後悔をテーマにしたVRループアニメの制作を呼びかける。
両親から完璧を求められ、優等生を演じてきたいと（彭城遥）は、自身の衝動的な感情をアニメの作画に叩きつけ、可愛いものを愛しつつもその姿を隠すユズ（麻薙結弦）は、技術と音響で理想と現実の狭間を描く。
自分の思いを文字に起こすらて.（河神蘭）。

彼らが夜な夜な創り出す「変えられない過去を、何度でも体験させる」アニメは、未来のネット社会で静かに熱狂的な支持を集めていく。

しかし、アニメの制作が進むにつれ、メンバーたちは自身の後悔の核心に触れざるを得なくなる。
特に、ユズが抱える「本心を隠している」苦しみは、いとの絵の「衝動」に呼応し、二人の関係は「救う者」と「救