ある日、普通の高校生だったユウトは事故により命を落とし、目覚めるとそこは“全人類が一つの能力（コード）を持つ”近未来の異世界だった。

しかし彼に与えられた能力は――「無」。
この世界では「無能力者」は差別され、徹底的に見下され、時には暴力の対象にもなる。

だがユウトは、古代言語で記された謎の文書《ゼロコード》と出会う。

それは「能力を持たない者にのみ開かれる力」、つまり「能力そのものの構造を読み解く力」だった。

孤独と劣等感の中、ユウトは仲間であるエリス（重力能力者）や、謎の人物教授の導きによって、“戦略・技術・思考”を武器に能力者たちに立ち向かっていく。