高校２年生のレイ(男子)と、同じクラスに転校してきた少女、エメラルド(名前)と、とある出来事をきっかけに、2人は、共に過ごす時間が増えてくる。
レイは、エメラルドと関わっていくうちにエメラルドの誰にも言えない秘密を知ることになり、やがて、その秘密はなんの接点のないと思っていたはずのレイの過去と深く関わっていて…
少女の秘密、2人の過去、そして、少女のエメラルドという名前にこめられた意味とは？？