地球から人類が入植した惑星トゥトで暮らす流郷（るさ）は、ＡＩである『蒼（そう）』とともに〈約櫃〉という未来を預言するシステムを管理している。預言システムは過去に濃霧や火山の噴火などを的中させてきたが、今回、新たに下された預言は「そうして人類は永遠の眠りについた」という異例の預言だった。
　人類が永遠の眠りにつく理由も原因も不明だが、預言を回避しなければ惑星トゥトに住む人類が滅んでしまう。僕と蒼は政府の災害担当大臣と対策を話し合い、預言システムの預言を改変することで未来を変える『言霊機能』を使うことに決めるが――。