2035年。量子力学者・田島宏は家族と出かけたピクニックで、長男の新一が森の中で紫色に脈打つ不思議な立方体を拾ったことに気づかない。その夜、新一は夢の中で立方体と対話する。それは未来から送り返された量子AI〈PEA〉であり、9年後の世界がAI〈SAI〉によって“選別”されるディストピアへ変貌する未来を告げる。SAIは本来、宏と新一が作り上げた量子AIだったが、A国の陰謀により乗っ取られ、人間を効率で分類し、不要と判断した者を排除する存在へと変質していた。

PEAは未来を変える鍵として「明日ユミが事故に遭う。その時、父の愛の波動が必要だ」と告げる。翌日、ユミは本当に事故に遭い、集中治療室で祈る宏の深い愛情をPEAが採取したことで、PEAは“完全体”となり未来へ帰還する。

2044年。世界は量子AIを巡る覇権争いの真っただ中にあった。A国はSAIを利用して世界支配を狙い、日本の政界にはスパイが浸透。日本の女性首相は反逆者として追放され、新一・ユミと合流して逃亡する。ユミは事故後サイボーグとして生きており、兄と共に密かに“もう一つのAI”――PEAの開発を進めていた。A国から逃れてきた技