ゾンビアポカリプスの終焉は思いのほか呆気ないものだった。ゾンビは肉体を維持できず朽ち果てていき、都会はたちまち腐敗のコンクリートジャングルになった。逃げ延びたコミュニティは残り少ない物資の確保のために「東京」に人員を送り込む。
「コレクター」の一人である義足の女性、ベゴニアは「東京」で産まれた未知の生物と人間のキメラに出会う。意思疎通が出来るその変な生き物「ナキ」に懐かれてしまったベゴニアはナキをコミュニティで庇いながら共に「東京」に行きナキが一体何なのかを探ることにする。