遠い宇宙にある天体、惑星クリステラは突然悪意ある宇宙人達によって滅ぼされた。▼太陽系にある地球で大学生である青年、水晶(すいしょう)クウヤは絶対絶命の危機に晒されし時、水晶の光に導かれて水晶の名を持つ光の巨人……ウルトラマンクリスタルに変身する。▼今、一人の青年と光の巨人の物語(ストーリー)が幕を開ける！！