世界の中心には、誰も近づかない湖がある。名を「ルフ湖」といい、そこに足を踏み入れた者は、自分の名前さえ忘れてしまうという。湖は静かで美しく、空を映す鏡のようだが、その底には何かが眠っていると古文書は語る。
少年アレンは、記憶を失っていた。目覚めたとき、彼はルフ湖のほとりに倒れていた。名前も過去も知らず、ただ胸に小さな水晶を握っていた。
湖畔の村「ミレア」で彼を見つけたのは、薬師の娘・セラ。彼女はアレンに名前を与え、村で暮らすよう勧めた。だがアレンは、夜ごと夢に見る水中の光景に導かれるように、湖の謎を探り始める。
ある日、水晶が光り、湖の底から声が響いた。
「記憶を返すには、水の門を越えよ。」
それは、世界に点在する「水の門」を巡る旅の始まりだった。