現代日本の過酷な労働環境に疲弊し、過労死寸前だった江藤雅人（29歳）は、トラックに轢かれ意識を失う。彼が次に目覚めたのは、魔法と自然が織りなす異世界エリュシオンだった。そこで女神エリュシアから「適応進化」というチート能力と、「暁の林檎」を守る使命を授けられる。
エリュシオンでは、100年に一度実る神聖な「暁の林檎」を巡る争いが絶えなかった。かつての「大調和時代」は終わり、「林檎戦争」の傷跡が深く残る世界で、人間の帝国ヴァルディアは林檎の軍事利用を目論み、エルフのシルヴァリス一族は林檎の守護を誓っていた。そして、元英雄であるダリウス率いる闇の勢力「黒燿会」が、林檎を奪い世界を支配するという野望を抱き、暗躍していた。